L’Azienda, nata nel 1959 come Società Finanziaria Cantieri Navali – Fincantieri Società per Azioni, si è trasformata nel 1984 in società operativa, a seguito della fusione per incorporazione di otto società da essa controllate, operanti nel campo della costruzione e riparazione navale e della realizzazione di componenti meccaniche e motori diesel. Nel gennaio 2013 ha raddoppiato le proprie dimensioni acquisendo il gruppo norvegese STX OSV attivo nel comparto offshore.
A Trieste si trovano la sede della società e gli uffici di Corporate che svolgono attività di supporto, indirizzo, coordinamento delle Unità di Business e delle società controllate.
I due maggiori centri di progettazione sono situati a Trieste e Genova. Sempre a Genova opera la Società Controllata CETENA che si occupa di ricerca in campo navale.
L’organizzazione di Fincantieri in Business Units riflette le specificità dei vari mercati.
Le Business Units si avvalgono di un network produttivo costituito da 21 stabilimenti che operano in modo fortemente integrato e due unità produttive dedicate alla fabbricazione di sistemi e componenti meccanici: 

Business Units	Unità Produttive
Navi Mercantili	Monfalcone (Gorizia), Marghera (Venezia), Genova-Sestri Ponente,  Ancona, Castellammare di Stabia (Napoli), Palermo
Riparazioni e Trasformazioni Navali	Palermo, bacini di Trieste, bacini di La Spezia
Navi Militari	Cantiere Integrato di Riva Trigoso (Genova) - Muggiano (La Spezia), Marinette Marine (Marinette, WI, USA), Bay Shipbuilding (Sturgeon Bay, WI, USA) e ACE Marine (Green Bay,WI, USA)
Sistemi e componenti navali	Riva Trigoso, Bari
Fincantieri Yachts	Muggiano (La Spezia)
Fincantieri Offshore	Trieste, Genova-Sestri Ponente, Ancona, Palermo
Vard	Brazil: Vard Niterói SA, Vard Promar SA - Norway: Vard Group AS (Headquarter), Vard Aukra, Vard Langsten, Vard Brattvaag, Vard Brevik, Vard Søviknes - Romania: Vard Braila SA, Vard Tulcea SA - Vietnam: Vard Vung Tau Ltd.

Le principali società controllate sono: Orizzonte Sistemi Navali S.p.A., Isotta Fraschini Motori S.p.A., Fincantieri Marine Systems North America Inc., Fincantieri Marine Group LLC e CETENA S.p.A. a cui si è aggiunta da gennaio 2013 STX OSV Holdings Limited.
Infine Fincantieri ha creato con Al Fattan Ship Industries la Joint Venture ETHIAD Shipbuilding grazie alla quale è presente anche negli Emirati Arabi.